公司实行执行董事领导下的总经理负责制， 内设七个部门， 并在成都和南京设有四川分公司、南京分公司两个外埠机构。

办公室：负责人事、资质管理、固定资产、后勤等行政工作

财务部：负责财务管理工作

项目管理部：负责与环保咨询相关的事务管理、招投标运营、合同管理等工作

项目一部：主要从事水利水电、交通（公路、铁路、轨道交通、长输管线、油气田开发、港口、航道等）行业咨询

项目二部：主要从事环境监理项目咨询及管理

项目三部：主要从事输变电行业咨询；负责组织环境监测工作的具体实施、检验检测管理体系的正常运行

项目四部：主要从事采掘行业及工业类项目咨询、新技术推广服务